メディアで大根踊りが取り上げられるたび、ネット掲示板やSNS上で定期的に巻き起こるのが「大根踊りは食べ物を粗末にしているのではないか」「もったいない」という批判や懸念の声です。青首大根の葉を振り回す姿を見て、「使い終わったらそのまま廃棄しているのではないか」と誤解する一般視聴者が後を絶ちません。
しかし、関係者や応援団OBへの取材、および公式の発信を検証すると、この疑惑は完全な誤解であることが分かります。食と農を学問の根幹に据える東京農大において、丹精込めて育てられた作物を粗末に扱うことは最大のタブーとされているからです。
応援で使用された生大根の「その後」には、厳格かつ合理的なルールが存在します。
神宮球場の東都大学野球応援やイベントで使われた生大根は、応援終了後に応援団員や運動部員が寮・合宿所に持ち帰り、調理して全員で完食します。定番メニューは、豚肉や野菜とともに大鍋で煮込む「大根汁（豚汁）」や煮物、おでん、浅漬けです。応援の衝撃で多少の傷やひび割れが生じることはあっても、土を洗い落として皮を剥けば味や品質には全く問題がありません。学生たちは「大地と生産者への感謝」を胸に、最後の一片まで綺麗に平らげています。
さらに、毎秋世田谷キャンパスで開催される名物イベント「東京農業大学 収穫祭」では、ステージ上で大根踊りが披露された後、来場者に向けた大根の無料配布（福分け）が行われます。毎年数万本規模の大根が用意され、何時間も前から大行列ができるほどの人気行事となっており、家庭の食卓へと大切に持ち帰られています。
なお、近年の箱根駅伝の応援現場などでは、長時間の移動や衛生面、沿道警備の観点から、生大根だけでなく練馬大根を模したエアバルーン型応援グッズやプラスチック製メガホンも積極的に導入されています。伝統の生大根と現代的な応援グッズを適切に使い分けることで、食品ロスの防止と応援マナーの向上が図られています。
