SNSや口コミサイトの投稿を分析すると、来館者の満足度を著しく下げている最大の要因は「館内の過密な混雑」と「歩き疲れ」に集約されます。那覇市内から高速道路を利用しても片道約2時間弱かかる北部の立地ゆえ、観光客の行動パターンには驚くほど顕著な偏りが生じます。
那覇市内のホテルを朝9時頃に出発した観光客や、大型観光バスツアーが一斉に到着するのが11:00から15:00の間です。このピークタイムに突入すると、「黒潮の海」大水槽の正面アクリルパネル前は幾重もの人垣で埋め尽くされ、小さな子ども連れでは魚を見ることすら困難になります。
現場を熟知するプロが推奨する「美ら海水族館 混雑回避の時間帯」は、明確に以下の2つの時間枠に絞られます。
- 朝一番（8:30開館〜10:00）：観光バスが到着する前の静寂な時間帯。透明度の高い水槽を独占に近い状態で鑑賞可能。
- 夕刻（16:00以降〜閉館）：団体客がホテル街へ引き上げ、館内が穏やかな落ち着きを取り戻すゴールデンタイム。
旅行全体の計画を狂わせないための「美ら海水族館 所要時間の目安」は、水族館の有料エリア単体であれば約1.5時間から2時間が基準です。しかし、後述する無料エリアのイルカショーやマナティー館、ウミガメ館までしっかり網羅する場合は、移動時間を含めて最低でも3時間から4時間の枠をスケジュールに確保しておく必要があります。
また、大水槽の目の前で優雅なティータイムを過ごせることで絶大な人気を誇るカフェが「カフェ オーシャン」です。水槽に隣接した有料指定席について「カフェ オーシャン 特等席 予約は事前にネットでできるのか？」という質問が絶えませんが、事前Web予約は不可となっています。当日、カフェ入口にある専用発券機で整理券を受け取るシステム（時間指定制・50分入替）となっており、お昼時は60分〜90分待ちになることも珍しくありません。特等席を確実に狙うなら、水族館入館直後に直行して発券を済ませるのが鉄則です。
