Web上の一部ブログやSNSでは、木酢液に関して科学的根拠を欠いた極めて危険な情報がまことしやかに語り継がれています。その最たる例が、木酢液のイボ治療の真相をめぐる民間療法の流布です。
「綿棒に木酢液の原液をつけてイボやタコに湿布するとポロリと取れる」「水虫が劇的に治る」といった体験談が散見されますが、これは皮膚科学的に見て極めて危険な行為です。木酢液は薬機法上の医薬品・医薬部外品ではなく、人体への塗布を想定して作られた治療薬ではありません。原液を皮膚に直接接触させる行為は、強酸によるタンパク質の変性を利用して無理やり患部を壊死させているだけであり、実態は「化学熱傷（化学やけど）」そのものです。重篤な接触皮膚炎、ケロイド状の瘢痕（キズ跡）、深刻な色素沈着を引き起こすリスクが高く、皮膚科の専門医も強く警鐘を鳴らしています。肌トラブルの治療目的で原液を塗布することは絶対に避けなければなりません。
さらに見過ごせないのが、木酢液のデメリットと危険性に直結する「品質のバラつき」です。木酢液には公的な法的義務を伴う一律の規格基準が存在せず、粗悪品から高品質な精製品までが同一の売り場に混在しています。粗悪な未精製木酢液には、炭化工程で生じるベンゾピレンなどの多環芳香族炭化水素（発がん性物質）を含む有害な木タールが分離されずに残存しているケースがあります。購入時は、日本木酢液協会（現・一般社団法人 日本木酢液・竹酢液認証協議会等）の認証マークがあるものや、製造元が静置期間（最低6カ月以上）と精製方法を明記している信頼性の高い製品を選ぶ鑑識眼が不可欠です。
なお、店頭でよく比較されるのが木酢液と竹酢液の違いです。竹を原料とする竹酢液は、木酢液よりも酢酸濃度がやや高く、タール分の沈殿が早い傾向があります。また、燻製臭の中に特有の甘酸っぱさがあり、木酢液特有のツンとした焦げ臭さが控えめなため、入浴用や室内周辺の消臭には竹酢液が選ばれるケースが増えています。基本的な殺菌・忌避メカニズムは同等ですが、香りの好みや精製スピードに差異があります。
