映画本編において、観客の間で長年最大の謎として議論されてきたのが「なぜ頑迷だった父親（宮水俊樹町長）が、最終的に住民避難の決断を下したのか」という点です。劇場版では三葉が役場に乗り込み、父と対峙する場面で画面が切り替わるため、具体的な対話内容は描かれていません。
この真相を解く鍵は、新海誠監督監修のもと執筆された公式スピンオフ小説『君の名は。 Another Side:Earthbound』に明記されています。そこには、三葉の母親である宮水二葉（ふたば）の知られざる過去と、父・俊樹の魂の遍歴が描かれていました。
かつて外部からやってきた民俗学者・溝口俊樹は、宮水神社の巫女として町民から現人神のように慕われていた二葉の神々しい美しさと慈愛に惹かれ、婿養子に入り宮水姓を名乗りました。二葉は人々の病気や悩みを言い当てる霊的な力を持ち、町民から崇敬されていましたが、三葉が幼い頃に病で早逝してしまいます。
妻を救えなかった現代医学と、妻の死を「神の思し召し」として平然と受け入れた宮水家の信仰に絶望した俊樹は、神社を飛び出して政治の世界へ身を投じました。町長となった彼は、神社という非合理な信仰を排し、近代的なインフラで町を守ろうと邁進していたのです。
避難所開設を訴えに来た三葉と対峙した際、俊樹は娘の目の中に、かつて最愛の妻・二葉が語っていた「誰かと入れ替わる不思議な体験」の記憶と、二葉自身の面影を直感しました。「お前は、誰だ」と問うた俊樹は、宮水の血筋が代々経験してきた入れ替わりという神託が、まさに「この彗星災害から町民の命を救うために受け継がれてきた防御システム」であったことを悟ったのです。妻の死と宮水の呪縛を乗り越え、科学者としての直感と父親としての愛情が合致した結果、町内一斉避難訓練の指示が下されました。
【プロの結論】家族社会学と世代間トラウマの昇華に見る教訓
宮水家の歴史を家族社会学的な視点で紐解くと、母・二葉の喪失によって引き裂かれた「父と娘の心理的ディスタンス」の回復物語であることが分かります。親世代の背負った未解決の悲哀（世代間トラウマ）が、娘の命がけの行動によって受け止められ、長年閉ざされていた父親の心が氷解するプロセスは、単なるSF設定を超えた人間ドラマの厚みをもたらしています。
