私立高校を選択する家庭にとって、費用面は避けて通れない最重要課題です。東洋大牛久高校の学費は、茨城県内の私立高校の中では標準的な水準に位置しています。
初年度に必要な経費の目安は、入学金（約20万円）、授業料（年間約40万円）、施設維持費・教育充実費（年間約15万〜20万円）、諸会費などを含めて約80万〜85万円前後です。これに加えて、制服代、制定品代、タブレット端末購入費用、修学旅行積立金などが加算されるため、初年度の総支払額は約95万〜110万円程度となります。2年次・3年次は年間約60万〜70万円程度が目安となります。
コストパフォーマンスを左右するのが国の「高等学校等就学支援金制度」および茨城県独自の減免制度です。世帯年収に応じて授業料の一部または全額が支援されるため、年収約590万円未満の世帯であれば授業料実質無償化の対象となり、公立高校との実質的な教育費差は大幅に縮まります。
さらに、同校には学力・スポーツに秀でた生徒を対象とした「特待生制度（奨学生制度）」が設けられています。入試の成績上位者に対して入学金や授業料の全額・半額を免除する措置があり、公立トップ校を狙える学力を持ちながら、手厚い学習環境と特待資格を理由に東洋大牛久の特進コースを選択する優秀層も存在します。
