マーイーカの色違いを入手した際、あるいはフィールドで遭遇した際に最も気になるのが「通常色との視覚的な差異」です。公式グラフィックおよび実機での検証データを突き合わせると、その配色は非常に明確なコントラストを持っています。
通常色のマーイーカは、発光器官を持つ頭部や胴体が涼しげなシアンブルー（水色）を基調としています。これに対し、マーイーカの色違いは胴体部分が鮮やかなレモンイエロー（黄緑がかった黄色）へと大胆に変化します。頭部の発光体や触手先端のピンク色はそのまま維持されるため、黄色とピンクのポップなツートンカラーとなり、フィールド上でも遠目から判別しやすい部類に入ります。
さらに注目すべきは、進化形である色違いカラマネロの見た目です。通常色のカラマネロは深みのあるダークマゼンタと紫がかった藍色で構成され、あく・エスパー複合タイプらしい妖艶でダークな雰囲気を漂わせています。しかし色違いになると、メインボディが鮮烈なエメラルドグリーン（ターコイズブルー）へと反転し、下部の触手や帯状パーツがイエローに変化します。この劇的なビジュアルの変貌は、全ポケモンの中でもトップクラスのインパクトを誇り、多くのトレーナーが色違い厳選に熱中する最大の要因となっています。
