海遊館単体での割引がない反面、天保山ベイエリアの周辺アトラクションを一緒に楽しむ場合は、公式に販売されているセット券を利用することで大幅な割引メリットを享受できます。
代表的な選択肢が海遊館と天保山大観覧車のセット券料金です。海遊館のすぐ隣にそびえる高さ112.5メートルの大観覧車は通常一般料金が900円（3歳以上均一）ですが、セット券を購入することで通常合計3,600円のところ3,300円前後（約300円割引）で両施設を楽しめます。水族館を楽しんだ後に大阪ベイエリアのパノラマ夜景を一望するコースは、観光やデートプランとして鉄板です。
さらに観光気分を盛り上げたい方には、海遊館とサンタマリア号クルーズのセット券がおすすめです。大阪港内を約45分かけて優雅に周遊する帆船型観光船「サンタマリア号」（デイクルーズ通常大人1,800円）とのセットは、通常合計4,500円が3,900円前後（約600円割引）となり、割引額が非常に大きくなります。
これらのセット券は、海遊館の窓口や公式チケット購入ページから指定して入手できます。海遊館単体で過ごすよりも1日の充実度が跳ね上がるため、天保山エリア一帯を満喫するならセット券を選ばない手はありません。
