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主な原因は、体内を巡る女性ホルモン（エストロゲンとプロゲステロン）の急激な減少と、その後の不安定な分泌状況にあります。人工的に一定に保たれていたホルモン量が突然リセットされるため、体は一時的なパニック状態に陥ります。

さらに、女性ホルモンの分泌をコントロールする脳の視床下部は、自律神経のコントロールセンターでもあります。そのため、ホルモンの乱れはダイレクトに自律神経の乱れへとつながり、頭痛、イライラ、不眠、胃腸の不調といった全身性の症状を引き起こしやすくなります。