管轄の保健所が実施した詳細な検体検査と追跡調査により、汚染のメカニズムが徐々に明らかになってきた。回収されたマフィンから検出された菌数は、安全基準値を桁違いに超過。製造から販売までの数日間にわたり、生地の内部で爆発的な微生物増殖が起きていた動かぬ証拠が突きつけられた。
最大の盲点は、焼成後の「徐冷プロセス」と「密閉保存」にあった。高温で焼き上げられたマフィンであっても、中心温度が下がりきる前に室温で放置されれば、内部は菌にとって格好の培養器と化す。とくに厚みのあるマフィンは熱がこもりやすく、危険温度帯（20℃〜50℃）に長時間留まる構造的弱点を抱えていた。
2026年の現行衛生指針に照らし合わせても、密閉包装のタイミングと温度管理の初歩的な逸脱は明白だ。防腐剤を使用しない製品でありながら、保冷設備を介さず常温で数日寝かせるという運用が、菌の増殖を決定づけた。家庭用オーブンでの大量生産というキャパシティオーバーが招いた人為的失策である。
