神社と寺院の違いを理解するうえで、インターネット上で広く信じられている典型的な俗説や誤認を正しておく必要があります。
まず代表的な誤解が、「お稲荷さん（稲荷）はすべて神社である」という思い込みです。朱塗りの鳥居や狐の像が並ぶ光景から、多くの人は無条件に神社だと思い込みがちですが、愛知県の「豊川稲荷」をはじめとする著名な稲荷信仰の一部は曹洞宗の寺院（正称：妙厳寺）です。豊川稲荷で祀られているのは「鎮守・荼枳尼天（だきにてん）」という仏教の守護神であり、境内に鳥居が立ち並んでいても本堂では手を打たず合掌するのが正しい礼儀です。
また、「浅草寺（せんそうじ）と浅草神社（あさくさじんじゃ）は同じ施設である」という混同も頻繁に見られます。両者は東京都台東区の同一エリアに隣接して鎮座していますが、浅草寺は聖観世音菩薩を本尊とする聖観音宗の総本山寺院であり、隣接する浅草神社は浅草寺の草創に関わった3人の郷土の偉人を祀る神社です。歴史的に神仏分離令によって別法人へと明確に分かれた経緯があり、参道を進む際には「どちらの境内に入っているのか」を意識しなければ参拝作法を誤ることになります。
さらに、鐘楼（鐘をつく設備）や五重塔があるからといって100％お寺とは言い切れない事例も例外的に残存しています。日光東照宮のように神仏習合の色を色濃く残す特別な霊場では、神社でありながら五重塔がそびえ立ち、境内の美術様式にも仏教意匠が散りばめられています。こうした例外を見極めるためにも、現地の手水舎の先にある拝殿に「鈴」があるのか、本堂に「鰐口（わにぐち）」や「ドラ」があるのかを確認する観察眼が求められます。
