「止まると死ぬのであれば、マグロはいつ寝ているのか」という疑問は、生物学者たちを長年惹きつけてきました。かつては睡眠をとらないのではないかとも囁かれましたが、近年のバイオロギング調査や脳波解析によって、マグロは睡眠を泳ぎながらとっている実態が明らかになっています。
マグロの休息様式は、人間の「熟睡」とはまったく異なります。夜間になると遊泳速度を通常の半分程度（時速2〜3kmほど）まで落とし、必要最低限の推進力を維持しながら、一種の省エネモード（巡航モード）に移行します。このとき、脳の活動レベルを低下させつつ、姿勢維持や尾ビレの反復運動を反射的・自律神経的にコントロールしていると考えられています。
イルカや渡り鳥のように右脳と左脳を交互に眠らせる「半球睡眠」を行っている可能性も強く指摘されており、周囲の危険を察知するセンサーを完全にオフにすることはありません。寝ている間もゆっくりと広大な円を描くように泳ぎ続け、最低限のエラ換水量を確保しながら、翌朝の狩りに備えてエネルギーを充填しています。
