結論から述べると、「確認いたしました」は文法的に完璧な敬語であり、二重敬語には該当しません。この表現は、動作を表す名詞「確認」に、「する」の謙譲語(謙譲語II・丁重語)である「いたす」、そして過去形の丁寧語「ました」が組み合わさった構造を持っています。
二重敬語とは、同じ種類の敬語(例えば尊敬語+尊敬語、謙譲語+謙譲語)を1つの単語に重複して重ねてしまう誤用(例:「ご覧になられる」「お伺いいたす」など)を指します。「確認いたしました」は謙譲語+丁寧語の正規の接続であるため、敬語の指針に照らし合わせても全く問題のない正しい敬語表現です。
ただし、文法上は正しくても「状況によって相手に与える印象が変わる」という現場特有の課題が存在します。例えば、役員クラスの重役や重要顧客に対して単に「確認いたしました」とだけ返すと、受動的で素っ気ない印象を与えてしまうケースがあります。言葉の正確性を担保したうえで、前後に感謝の言葉や次のアクションを一言添える配慮が求められます。