私立高校への進学で保護者が最も懸念する学費面について、興南高校では充実したスカラシップ制度が整えられています。興南高校学費免除特待生は、主に「学業特待」と「スポーツ・文化特待」の2軸で運用されています。
学業特待生は、入試成績および内申点優秀者を対象に、A特待（入学金・授業料全額免除）、B特待（授業料半額免除）などの段階的な支援が用意されています。特進コース合格者の上位層には、国公立高校と変わらない、あるいはそれ以上の経済的優位性で私立の手厚い進学指導を受けられるチャンスが広がっています。
ただし、特待生資格は入学後も毎年の学業成績や生活態度によって継続審査が行われるため、合格後も高い学習モチベーションを維持し続ける規律が求められます。
