国立代々木競技場を訪れる際、初めての方が混乱しやすいのが「第一体育館」と「第二体育館」のスケール感や用途の違いです。隣り合ってそびえ立つ両施設ですが、会場の規模や構造には大きな差が存在します。
第一体育館が最大約13,000人規模のメガアリーナであるのに対し、第二体育館の収容人数（キャパシティ）は約3,200席（イベント形式によりアリーナ席を増設して約4,000席規模まで変動）となっています。巨大な第一体育館と比べると小規模に思えるかもしれませんが、このコンパクトさこそが第二体育館最大の武器です。どの座席からでも演者や選手の表情、息遣いまで手に取るように感じられる濃密な空間が広がっています。
また、第一体育館が長方形のフロア形状を持つ吊り屋根構造であるのに対し、第二体育館は中央の一本の主柱からケーブルで屋根を吊る円形構造を採用しています。この建築デザインの違いが、内部の座席配置と視界の抜けの良さに直結しています。
