神社の歴史を調べる読者がインターネット検索で最も混乱しやすいのが、「伊射奈美神社 吹田市」という検索クエリと、徳島県美馬市の実情とのギャップです。「吹田市にも伊射奈美神社があるのか?」という疑問を抱く人が後を絶ちません。この謎を解く鍵は、大阪府吹田市山田東に鎮座する式内社「伊射奈岐神社」の歴史的由緒に隠されています。
社伝および『摂津名所図会』などの記録によると、吹田市の伊射奈岐神社は雄略天皇の御代に伊勢神宮斎宮の神託によって創建されたと伝えられます。興味深いことに、吹田市内には「山田」と「佐井寺」の2カ所に伊射奈岐神社が存在します。古くからの記録では、佐井寺の宮に伊弉諾尊を祀り、山田の宮には伊弉冉尊を祀って「伊射奈美神社」あるいは「姫宮」と称し、両社で一対の祭祀を執り行っていた時期が存在しました。
明治期の近代社格制度の整理や合祀の過程で、吹田市の神社はいずれも公的な社号を「伊射奈岐神社」として統一されましたが、地域住民や古文書の間では「一対となる伊射奈美の神」の記憶が脈々と受け継がれてきました。つまり、制度上の正式な式内社「伊射奈美神社」は徳島県美馬市にのみ存在し、大阪府吹田市にはイザナミの神霊を深く祀り続けてきたもう一つの歴史的結節点が存在するというのが真相です。