南風病院の診療機能において、県内外から広く知られているのが「消化器病センター」の実績です。消化器内科と消化器外科が強固に連携し、食道・胃・大腸・肝臓・胆嚢・膵臓疾患に対する診断から内視鏡治療、高難度手術までを一元的に提供しています。センターを牽引する名医陣は、日本消化器病学会や日本消化器内視鏡学会の指導医・専門医資格を有するベテラン医師が揃い、早期がんに対する内視鏡的粘膜下層剥離術（ESD）や腹腔鏡手術において県内有数の症例数を積み重ねてきました。「他の医療機関で見落とされかけた微小病変を正確に発見してもらえた」という患者の証言もあり、診断技術の精度には定評があります。
もう一つの重要な柱が「緩和ケア病棟（ホスピス）」です。がん患者の身体的・精神的な苦痛を和らげ、その人らしい穏やかな生活を支援するための専用フロアが設けられています。病棟内は木目調の落ち着いたインテリアで統一され、家族控室やキッチン、季節の移ろいを感じられる庭園など、病院らしさを抑えた居住性の高い空間が整備されています。費用面では、緩和ケア病棟入院料として健康保険や高額療養費制度が適用されるため、自己負担額は一定水準に抑えられますが、個室を選択した場合は設備に応じた室料差額（差額ベッド代）が発生します。医師、看護師だけでなく、医療ソーシャルワーカー、薬剤師、臨床心理士、栄養士による多職種カンファレンスが綿密に行われており、終末期を支える温かな体制に対する遺族からの感謝の声は絶えません。
