公立小学校への進学・転入で最初のチェックポイントとなるのが通学区域（学区）です。学校名には「水谷東」と冠されていますが、実際の所在地は大字水子に位置しており、境界線周辺の居住地選びでは正確な区分確認が欠かせません。
富士見市教育委員会が定める通学区域規則によると、水谷東小学校の主な学区は「水谷東二丁目・三丁目」の全域および「大字水子」の一部地域で構成されています。周辺には新河岸川や柳瀬川が流れ、平坦な地形が広がる穏やかな住宅地が形成されています。
小学校卒業後の進学先中学校は、原則として「富士見市立水谷中学校」となります。水谷東小学校と水谷中学校は小中一貫教育の視点から教員間の情報共有や合同研修を行っており、進学時のいわゆる「中1ギャップ」を緩和する取り組みが進められています。小学校高学年での部活動体験や中学校教員による出前授業など、スムーズな進学移行を支える仕組みが整っています。
交通アクセスとしては、東武東上線の「柳瀬川駅」「みずほ台駅」「志木駅」などが生活圏の最寄り駅となります。駅前商業地と学校周辺の閑静な住宅街が適度に分離されており、子育て世帯が落ち着いて暮らせる立地条件を備えています。
