過密ダイヤの中央線では、人身事故や悪天候による遅延が度々発生します。運行障害が発生した際、速やかに代替ルートへ切り替えられるかどうかが重要です。
阿佐ヶ谷エリアにおける最強の迂回ルートは、南へ徒歩約8〜10分の位置にある東京メトロ丸ノ内線「南阿佐ヶ谷駅」の利用です。南阿佐ヶ谷駅から新宿駅までは乗り換えなしで約13分。JR線がストップした際の最優先リカバリー手段として機能します。また、北側へ移動すれば西武新宿線の鷺ノ宮駅や下井草駅を利用して西武新宿駅へ抜けるルートも選択肢に入ります。
深夜帯の移動に関しては、平日の新宿駅から阿佐ヶ谷駅への終電は0時台半ばまで各駅停車が運行されています。万が一終電を逃した場合、新宿駅から阿佐ヶ谷駅までのタクシー料金は深夜割増を含めて約3,500円〜4,500円程度、所要時間は青梅街道経由で約20〜25分が目安となります。