展示室は、大和盆地を中心とする考古遺物を時代順（旧石器・縄文・弥生・古墳・飛鳥・奈良・平安・中世）に辿ることができる構成になっています。教科書に掲載されている著名な遺跡の出土品が次々と現れるため、日本の黎明期を追体験できるドラマチックな空間です。
特に古墳時代の展示エリアでは、埴輪（人物・動物・家形など）の多様な造形美や、鉄製武具・農具の技術革新が分かりやすく整理されています。単にモノを並べるだけでなく、発掘調査時の埋葬状況を再現したジオラマや復元模型が効果的に配置されており、専門知識がない初心者でも当時の社会構造や死生観を直感的に理解できる工夫が施されています。
