観音院の知名度を一気に高めたもう一つの要素が、意匠を凝らした限定御朱印の存在です。季節の移ろいを表現した色鮮やかなデザインや、繊細な筆遣いで描かれたお地蔵様の姿は、御朱印愛好家の間でも極めて高い評判を誇ります。
特に月替わりの絵入り御朱印や、毎月24日の縁日限定で授与される特別な墨書は、集めるごとに心洗われるような美しさがあります。寺務所では丁寧な手書き対応が行われていますが、混雑時には書き置き対応となる場合もあるため、時間に余裕を持った訪問が推奨されます。参拝の確かな証として、大切に持ち帰る参拝者が後を絶ちません。