ポケモンカフェと同じ建物内に構える「ポケモンセンタートーキョーDX」は、日本最大規模のポケモングッズ常設店舗のひとつだ。カフェ利用者の多くがこの二つをセットで楽しむのは当然だが、効率的な周り方には戦略が要る。
まずポケモンセンタートーキョーDXはカフェと異なり予約不要で入店できる（混雑時は入場制限あり）。そのため、カフェの予約時間より45分前後早めに日本橋に到着し、先にポケモンセンターでグッズ購入を済ませてからカフェへ向かう動線が最も無駄が少ない。逆の順序でカフェを先にすると、食事後の高揚感でグッズを衝動買いしすぎるリスクがある（それはそれで良い思い出になることも多いが）。
カフェ限定グッズは公式サイトによると「カフェでの体験にしか出会えない」ラインナップとして位置づけられており、ポケモンセンター店舗では購入不可のアイテムが含まれる。2026年夏のコラボグッズとしては、リニューアル記念の限定アクリルスタンドや、季節限定フード柄のランチョンマット型クリアファイルなどが確認されている。これらはカフェ内のショップコーナーでのみ販売され、在庫がなくなり次第終了となるため、カフェを出る前か入店後すぐにグッズコーナーをチェックすることを強くすすめる。
日本橋エリアは「東京日本橋ポケモン関連スポット」の聖地として、ポケモンカフェ・ポケモンセンタートーキョーDX以外にも周辺に複数の観光スポットが揃っている。コレド室町テラスの飲食・ショッピング、日本橋三越本店、水天宮など歴史的スポットも徒歩圏内にあり、半日〜一日かけて日本橋全体を楽しむ「ポケモン聖地＋江戸文化探訪」プランとして組み合わせると旅の密度が格段に上がる。
