交通費と聞くと「給料とは別物だから税金は関係ない」と考えがちですが、ここにも重大な法制度上の盲点が隠されています。国税庁が定める税制において、通常の通勤手当にはバイト交通費非課税限度額詳細まとめとして知られる非課税規定が適用されます。2026年現在、公共交通機関を利用する場合の通勤手当の非課税限度額は最高月額15万円までと設定されています。
非課税限度額の範囲内であれば、支給された交通費は所得税の計算対象から除外されます。そのため、学生や主婦（夫）が最も気にする扶養控除バイト交通費103万の壁（親や配偶者の扶養親族から外れるかどうかの基準）において、非課税となる通勤手当は「年収103万円」の計算枠にカウントされません。実費に基づく正規の通勤手当であれば、年収上限を圧迫することはないのが原則です。
しかし、ここで注意すべきは「実態を伴わない交通費」や「一律支給手当」の扱いです。通勤実態のない架空の申請であったり、就業規則上で通勤経路の確認を行わずに基本給に上乗せして一律支給している場合、税務署から「通勤手当ではなく実質的な給与（労働の対価）」とみなされるリスクが生じます。万が一給与として認定された場合、交通費分も103万円の枠内に算入され、意図せず扶養枠を超過してしまうという悲劇が起こります。
実際、確定申告シーズンになるとバイト交通費確定申告ネットの反応として、「バイト先から送られてきた源泉徴収票の支払金額に交通費が含まれていて、親の扶養から外れそうになりパニックになった」「交通費が課税所得に合算されていたため所得税が引かれていた」といった相談や悲鳴が急増します。雇用主が通勤手当を税法上どのように処理しているのかを給与明細で確認することは、自身の税務ステータスを守る上で不可欠です。
