生理の始まりとともに「急にお腹がゴロゴロ鳴り出し、ガスが止まらなくなる」という現象の背後には、子宮と腸の密接な位置関係およびホルモンの生化学的反応が存在します。最大の引き金となるのが、剥がれ落ちる子宮内膜から分泌される生理活性物質プロスタグランジンです。
プロスタグランジンには経血を体外へ押し出すために子宮の平滑筋を強く収縮させる働きがあります。しかし、この物質が過剰に分泌されて血流に乗ったり周辺組織へ拡散したりすると、隣接する大腸や小腸の平滑筋まで巻き込んで激しく収縮させます。これがプロスタグランジン腸への影響であり、腸の蠕動（ぜんどう）運動が急激に活発化することで、内部に溜まっていたガスや便が一気に直腸へと送り出され、生理中おならが止まらない原因となります。
一方、生理中おなら臭い理由の根底にあるのは、月経直前までのホルモン環境です。排卵後から生理直前にかけて分泌のピークを迎える黄体ホルモン（プロゲステロン）には、受精卵を着床しやすく保つために体内の水分を溜め込み、消化管の運動を抑制する作用があります。その結果、生理前は頑固なプロゲステロン便秘ガスの停滞が発生しやすくなります。
腸内に便が長期間滞留すると、腸内細菌叢において悪玉菌（ウェルシュ菌など）が優位になり、未消化のタンパク質を腐敗発酵させます。この過程で生じるのが、卵が腐ったような強烈な悪臭を放つ硫化水素やインドール、スカトールといった揮発性物質です。生理が始まった瞬間にプロスタグランジンの刺激によってこの溜まったガスが一気に排出されるため、生理中おなら硫黄臭を伴う強いにおいとなって自覚されるのです。
