縮毛矯正とヘアカラーを両方行う場合、毛髪科学の観点から導き出される基本原則は「縮毛矯正を先に行い、後からカラーをする」という手順です。この順序を逆にしてしまうと、カラーリングで定着させた色素が著しく失われ、仕上がりの美しさが損なわれてしまいます。
カラーを先にして後から縮毛矯正をかけた場合、縮毛矯正の1剤に含まれるアルカリ剤と還元剤（シスチン結合を切断する成分）が、髪の内部に入り込んだ酸化染料を化学的に分解・脱色させてしまいます。さらに、縮毛矯正の工程では180度前後の高温アイロンによる熱処理が行われます。熱変性とともに染料が揮発・破壊されるため、施術直後から2〜3トーン以上も明るく色が抜けてしまったり、濁った不自然な色合いに変化したりする現象が起きます。
一方で、縮毛矯正を先に施した後にカラーを行えば、ストレートに固定された毛髪に対して色素を適切に定着させることができます。ただし、縮毛矯正直後の髪はキューティクルや毛髪内部のタンパク質がデリケートな状態にあるため、通常のカラーよりも色が沈み込みやすい（暗く発色しやすい）性質を持ちます。カウンセリング時には希望の明るさよりもやや透明感を残した薬剤選定を美容師と共有することが肝要です。
