水産庁や環境省の報告書において、ブラックバスが極めて危険な侵略的外来種として扱われる最大の要因は、圧倒的な在来種捕食問題とそれに伴う生態系への影響の深刻さにあります。
日本に定着している主なブラックバスは、北米原産のオオクチバス（ノーザン・ラージマウスバス）と、流水や低水温への適応力に優れたスモールマウスバスの2種類です。これらサンフィッシュ科の肉食魚は、自らの体長の半分近くに達する魚類を丸呑みできる巨大な口と、獲物を逃さない俊敏な捕食行動を持ち合わせています。
日本の河川や湖沼に生息する在来生物──モツゴ、タモロコ、ゼニタナゴといった小型純淡水魚、アユの稚魚、さらにはスジエビやヌマエビなどの甲殻類は、ブラックバスのように獰猛な魚食性フィッシュイーターと共進化してきた歴史を持ちません。そのため、外敵に対する警戒行動や回避能力が脆弱であり、バスが侵入した水域では瞬く間に在来種が捕食され尽くしてしまうのです。
実際、環境省や各地方自治体の水産試験場が実施した胃内容物調査では、捕獲された個体の胃から絶滅危惧種に指定されているシナイモツゴやゼニタナゴ、さらにはヤゴや水生昆虫が大量に検出されています。食物網の下位を支える小型水生生物が根こそぎ消え去ることで、水域全体の生物多様性が一気に崩壊し、水辺の自然環境が不可逆的な変容を遂げてしまうことこそが、決定的な問題視の理由です。
