交通利便性において、南古谷駅はJR川越線の途中駅でありながら独自の強みを持っています。駅のすぐ東側にJR東日本の「川越車両センター」が隣接しているため、朝の通勤時間帯を中心に南古谷始発の大宮・新宿方面行き電車が設定されています。
混雑が激しい埼京線直通の電車であっても、始発列車を狙えば確実に着席して新宿・渋谷方面へ通勤できる点は、毎日の通勤ストレスを大幅に軽減する決定打と言えます。大宮駅までは直通約18分、池袋駅へ約45分、新宿駅へも約50分でダイレクトアクセスが可能です。
しかし、南古谷駅の時刻表を確認する際には、単線運行に伴う特有のリスクを認識しておく必要があります。大宮〜川越間のJR川越線は単線区間が存在するため、日中時間帯の運行本数は1時間に3本（約20分間隔）程度にとどまります。さらに、埼京線や直通先のりんかい線・相鉄線内でトラブルが発生した場合、その遅延がダイレクトに波及し、単線ゆえに上下線のすれ違い待ちで遅れが拡大しやすいという混雑状況・運行ダイヤの構造的弱点が存在します。
