映画を観た多くの観客が抱く疑問が、「なぜ同じ水から分裂したのに、ストライプたちは最初からあんなにも邪悪なのか？」という点です。頭部に白いモヒカン状の毛を持つストライプは、誕生直後からギズモをいじめ抜き、時計の針を細工して夜中の食事をせしめるなど、極めて計算高い悪意を見せつけます。
この謎を解く鍵は、ジョージ・ガイペによる公式ノベライズ版に詳細に記された「モグワイの起源」という驚くべき裏設定にあります。小説版の記述によると、モグワイは地球の自然界で進化した生物ではなく、遙か彼方の惑星に住む天才科学者モグトゥルクによって「宇宙のあらゆる知的生命体に平和と愛を広めるための究極のペット」として遺伝子操作で人工的に生み出された生命体でした。
しかし、設計者であるモグトゥルクは重大な計算違いを犯していました。急速な細胞分裂やサナギ化による環境適応システムを組み込んだ結果、「全体のわずか1パーセント未満の個体しか温厚な精神を維持できない」という致命的な欠陥が生じてしまったのです。つまり、ギズモこそが奇跡的に安定したオリジナル（あるいは極めて稀な良性の個体）であり、急造のクローンとして増殖したストライプたちは、抑制の効かない凶暴性と原初的悪意をむき出しにしてしまう構造的な宿命を背負っていたのです。
なお、制作の裏側を明かした当時の特番インタビューによると、脚本の初期稿（クリス・コロンバス執筆）では「愛らしいギズモ自身が夜中に餌を食べてストライプに変身し、自ら町を破壊する」というショッキングなプロットでした。しかし、製作総指揮を務めたスティーヴン・スピルバーグが「ギズモはあまりにも魅力的で可愛い。彼を変身させて殺すのは観客が許さない。観客の相棒として最後まで生き残らせるべきだ」と強く主張し、ジョー・ダンテ監督が設定を変更したという生々しい舞台裏が存在します。
