「とんとんとんとんひげじいさん」の最大の強みは、その柔軟な構造にあります。基本のコード進行（C - G7 - Cなどシンプルな2〜3コード）と反復リズムが確立されているため、時代や子どもの関心に合わせて無数の替え歌が生み出されてきました。
中でも圧倒的な知名度を誇るのが「アンパンマンバージョン」です。
【アンパンマンバージョンの歌詞例】
とんとんとんとん アンパンマン（ほっぺに丸）
とんとんとんとん しょくぱんまん（手のひらで四角い顔）
とんとんとんとん カレーパンマン（頬を横につまむように尖らせる）
とんとんとんとん バイキンマン（頭の上に人差し指で角を作る）
とんとんとんとん ドキンちゃん（頭の上に一本指で角を作りウインク）
キラキラキラキラ 手はおひざ
子どもたちが大好きなキャラクターに置き換えることで、集中力が途切れがちな場面でも一瞬で全員の注目を集めることができます。さらに、クリスマス会用の「サンタさん・トナカイさん」バージョンや、節分用の「おにさん・ふくのかみ」バージョンなど、季節の行事に応じたアレンジが無数に存在します。
