先島諸島への主要なゲートウェイとなるのは、宮古列島の「宮古空港」「下地島空港」、および八重山列島の「新石垣空港（南ぬ島 石垣空港）」です。
羽田空港、成田空港、関西国際空港、中部国際空港、福岡空港など全国主要都市から直行便が多数就航しており、東京からでも片道約3時間〜3時間半でアクセス可能です。直行便の枠が埋まっている場合や地方発の場合は、那覇空港を経由して各離島へ乗り継ぐルートが一般的です。
島々の巡り方としては、宮古列島は宮古島を中心に「伊良部大橋」「池間大橋」「来間大橋」といった巨大な海上橋で結ばれているため、レンタカーでのドライブ観光が主流となります。一方、八重山列島は石垣港離島ターミナルを拠点として、竹富島や西表島、小浜島などへ高速船（フェリー）を使って島渡りを楽しむスタイルが基本となります。
