株式会社武蔵野を語る上で、2022年4月に発生した北海道・知床沖の観光船沈没事故（知床遊覧船「KAZU I」事故）との関わりは避けて通れません。この悲劇的な事故は、2ちゃんねるやSNSにおける同社への批判を決定的な段階へと引き上げました。
事故を起こした運航会社「知床遊覧船」の社長・桂田精一氏は、武蔵野の指導を受ける熱心な会員経営者でした。問題視されたのは、小山昇氏が自身の公式サイトやコンサルティング事例紹介記事において、桂田氏への指導プロセスを得意げに開示していた過去の記述です。そこには「経験豊富なベテラン船長を解雇し、素直に従う若いスタッフに入れ替えた」「値上げを行い高収益体質に変貌させた」といった旨の記述が存在していました。
事故後、安全管理を軽視した杜撰な運航実態が次々と明るみに出る中で、ネットユーザーによって当時の武蔵野側の広報ページが発掘・拡散されました。「安全を犠牲にして利益率を最大化させる指導を行っていたのではないか」「ベテラン切りを推奨した結果が海難事故を招いたのではないか」という怒涛の非難が巻き起こり、掲示板上では連日スレッドが乱立する事態へと発展しました。
報道各社による追及に対し、武蔵野側は「指導は一般的な経営管理や清掃に関するものであり、船舶の運航・安全管理そのものを具体的に指示した事実はない」との見解を示しましたが、ネット上の批判が収まることはありませんでした。この社会的責任の追及と信頼の失墜を受け、小山氏は2022年中に代表取締役社長を退任。後任へ経営権を移譲する運びとなりました。この知床事故の経緯は、同社のコンサルティング評価における最大の転換点として、現在も重い影を落としています。
