ストヘス区の捕獲劇以降、アニは調査兵団の地下深くに厳重に拘束・隔離され、何人たりとも傷つけられない結晶の中で時を止めました。しかし、物語後半の「天と地の戦い」へと向かう局面で、彼女は突如として覚醒します。
アニが結晶化から復活した直接の理由は、エレン・イェーガーによる始祖の巨人の力の発動です。エレンはパラディ島を囲む幾千万の超大型巨人の硬質化を解き、「地鳴らし」を開始しました。この際、エレンは「すべての硬質化を解いた」ため、パラディ島の壁だけでなく、アニを包んでいた水晶体、さらにはライナーの鎧の巨人の装甲までもが同時に強制解除されたのです。数年間にわたり意識だけが微かに漂っていたアニは、体力を著しく消耗しながらも自力で拘束を脱出しました。
