「やきとりさんきゅう」のフードメニューは、39円の看板串だけにとどまりません。幅広いニーズに応える充実のラインナップが揃っています。
看板の39円メニューには、もも、ねぎま、皮、レバー、砂肝、つくねなどの定番部位がしっかりと並びます。さらに、チーズつくねや明太マヨ串といった創作系串、豚バラ串や牛串などのプレミアム串（1本100円〜200円前後）も用意されており、飽きずに楽しめる構成です。
一品料理では、定番のポテトフライ、鶏の唐揚げ、出汁巻き玉子、ラーメンや焼き鳥丼などの締めご飯まで網羅されています。また、グループ利用に嬉しい飲み放題プラン（1,500円〜2,000円前後）を用意している店舗も多く、宴会や学生の飲み会でも予算を確定させて気兼ねなく楽しむことができます。
昨今の飲食業界全般における値上げの波を受け、サイドメニューや一部ドリンクの価格改定が実施されているものの、核となる「39円串」のシンボル価格は頑なに維持されています。なお、一部店舗ではテイクアウト（持ち帰り）にも対応していますが、店内飲食とは注文単位や価格条件が異なる場合があるため、事前確認が推奨されます。
