専門教育と並ぶ慶誠高校の大きな柱が、全国大会で旋風を巻き起こす部活動の存在です。なかでも慶誠高校バスケ部の実績は熊本県内にとどまらず、全国の高校バスケットボール界で広く知れ渡っています。
ウインターカップやインターハイ（全国高校総体）への連続出場を果たし、全国の強豪校と互角以上に渡り合う女子バスケットボール部は、緻密な戦術指導とハードワークを厭わないチームディフェンスが持ち味です。県外からの越境入学者やユース代表候補が集まり、切磋琢磨する環境はまさにトップレベルのアスリート育成拠点といえます。
バスケットボール部だけでなく、卓球部や陸上競技部などでも九州大会・全国大会レベルの選手が育っており、文武両道を掲げて学校全体に活気をもたらしています。強化指定部活動においては練習時間が長く、高い自己管理能力が求められるものの、仲間とともに頂点を目指す濃密な高校生活を送れる点が大きな魅力です。
