熊本国府高校の進学実績は、ここ数年で顕著な質の転換を遂げています。以前は私立大学や専門学校への推薦進学が中心でしたが、特進コースのカリキュラム改革に伴い、一般入試および総合型選抜での実績が大きく伸長しました。
主な進路先として、熊本大学、熊本県立大学といった地元国公立をはじめ、西南学院大学、福岡大学といった九州の有力私立大学への合格者が増加しています。さらに、指定校推薦枠を多数保有しているため、真面目に内申点を積み重ねた生徒が確実に関東・関西の有名中堅私大への進学権を獲得できる点も、私立ならではのメリットです。
またビジネス科では、金融機関、公務員、地元大手製造業などへの高い就職内定率を維持しており、「高校卒業後すぐに社会で自立したい」と考える生徒にとって確固たる選択肢となっています。
