タイトルの「アギト」という言葉には、複数の由来と重層的な意味が込められています。公式資料や企画書に記された記録によると、主な語源は以下の通りです。
- ラテン語の「agito」：「動かす」「揺り動かす」「行動を起こさせる」を意味する動詞。自発的に運命を切り拓くニュアンスを持ちます。
- 日本語の古語「顎（あぎと）」：開閉する顎の形状を模したクラッシャー（口元の意匠）や、大口を開けて進化を遂げる生物的なイメージを連想させます。
- 聖書のα（アルファ）とΩ（オメガ）：最初と最後を意味するギリシャ文字の間に挟まれた「AGITO」というスペリングから、神と人間の狭間で進化を続ける存在を暗示しています。
本作の敵勢力である「アンノウン」を率いる「闇の力（テオス＝神に相当する創造主）」は、人間を深く愛しながらも、自らのコントロールを超えて進化（＝アギト化）することを極度に恐れました。アンノウンが狙うのは「超能力に目覚めかけた人間」や「その血統を持つ者」に限定されていたという設定こそが、本作を単なる勧善懲悪から一線を画す本格サスペンスへと昇華させた決定的な要因です。
