クラゲが突如として大発生する背景には、海の中で複数の環境因子が連鎖的に作用するメカニズムが存在します。海洋生物学者の分析および水産研究・教育機構などの調査資料によると、最大の引き金は海水温の上昇です。
クラゲの生活史において、岩礁や人工構造物の下面に付着する無性世代「ポリプ」は、水温の上昇によって無性生殖が活性化します。水温が下がりにくい冬場を経ることでポリプの生残率が跳ね上がり、春先に一斉に無数のエフィラ（クラゲの幼変態）として海中へ遊泳分離するため、初夏からの爆発的な個体数増加につながるのです。
さらに、海洋生態系のバランス崩壊も増殖を後押ししています。クラゲの主な捕食者であるウミガメやカワハギ、ウマヅラハギといった天敵生物の生息密度が乱獲や沿岸開発で低下する一方、クラゲの餌となる動物プランクトンは富栄養化によって豊富に供給されています。食物連鎖の頂点が細り、下位のクラゲがニッチ（生態的地位）を独占する「海のクラゲ優占化」が各地で常態化しているのが真相です。
