海底を進む潜水艇がやがてたどり着くのが、神秘的なアトランティス神殿のエリアだ。ここには、知る人ぞ知る隠し要素がいくつも散りばめられている。巨大な神殿の柱や宝箱、沈没船の装飾はすべて精巧なレゴブロックで構築されているが、実は特定の宝箱付近に潜む「隠れキャラクター」や、特定のライティングによって浮き上がる刻印が存在する。
潜水艇の座席位置によっても見え方が異なり、進行方向右側の窓からは神殿の全貌と宝箱の隠しギミックが、左側の窓からは深い沈没船の内部がよく観察できる。乗車ごとに異なる発見がある設計は、リピーターを惹きつけてやまない魅力の真髄と言える。
