北村一輝のプライベートにおける家族関係にも注目が集まっています。家族構成としては、自身が育った実家の両親と兄、そしてプライベートでは1993年に一般女性と結婚し、翌年に長男が誕生しました。
その長男こそが、プロダンサーとして活躍する北村将清(きたむら しょうせい)です。将清はかつて大手芸能事務所に所属し、ドラマやCMなど俳優としての活動歴もありますが、現在はダンスの世界に情熱を注ぎ、アーティストのバックダンサーや振付師として第一線で評価を高めています。
2012年に前妻との離婚が成立したものの、父子の絆は極めて良好です。SNS等でも仲睦まじい姿が度々話題となり、父親譲りの整った容姿とダイナミックなダンスパフォーマンスで多くのファンを獲得しています。その後、北村一輝は2019年12月に40代の一般女性と再婚を発表し、公私ともに充実した環境を築いています。