多くの読者が抱いた最大の疑問が「なぜ肉付けされた巨人ではなく、骨だけの姿になったのか」という点です。この謎には、エレンが巨人化する直前に起きたガビ・ブラウンによる対巨人ライフルでの狙撃と、始祖の力の本質が深く絡み合っています。
ジークとの接触直前、エレンはガビの銃撃によって首を撃ち落とされ、胴体と頭部が完全に切断されました。物理的に即死する刹那、ジークの手によって頭部が受け止められ、意識は「道」へと到達します。そこでエレンは、2000年にわたり王家の奴隷として縛られていた始祖ユミルに対し、「お前は奴隷じゃない、ただの人間だ。決めるのはお前だ」と語りかけ、彼女の意志を解放しました。
現実世界に戻った瞬間、切り離されたエレンの首から「有機生物の起源（光るムカデのような生命体）」が急激に飛び出し、胴体と頭部を強引に再接続。通常の肉体再生プロセスを経る間もなく、巨大な脊椎と肋骨が異常増殖を遂げた結果、首から下が剥き出しの骨組みとなった巨大な姿が誕生しました。肉体を構成する暇もないほど凄まじい始祖の力の暴走と、首の切断という肉体的損傷が、あの骨の巨体を生み出した決定的な要因です。
