私立高校への進学を考える上で避けて通れないのが経済的負担です。昭和第一学園高等学校の初年度納入金（入学金・授業料・施設費・諸会費）の合計は約95万〜105万円程度となっており、東京都内の私立高校の平均相場と同等の水準です。
ただし、東京都が推進する私立高校授業料の実質無償化制度（所得制限の撤廃・助成対象の拡充）により、都内在住世帯であれば国の就学支援金と東京都の授業料軽減助成金を組み合わせることで、授業料負担は大幅に軽減されます。
ICT教育のための端末代や制服代、修学旅行積立金などの実費は発生するものの、放課後講習の充実によって「塾や予備校に過度に依存せず大学受験を目指せる環境」が整っているため、トータルの教育コストパフォーマンスは高いと評価されています。
