純ココアは単なる嗜好品にとどまらず、優れた機能性食品としての側面を持っています。カカオ豆由来の「カカオポリフェノール（エピカテキン等）」は高い抗酸化作用を持ち、血管内皮機能の改善や血圧低下、美肌効果が報告されています。さらに、リラックス作用をもたらす特有成分「テオブロミン」、腸内環境を整える「リグニン（不溶性食物繊維）」が豊富に含まれています。
臨床データおよび栄養学の知見に基づく純ココア健康効果と1日摂取目安量は、1日あたり大さじ1〜2杯（約5g〜10g）が適量とされています。カカオポリフェノールは体内に蓄積されにくく、摂取後数時間で血中濃度が低下するため、1度に大量摂取するよりも朝と午後の2回に分けて大さじ半分（約3g）ずつ継続的に摂取するスタイルが推奨されます。
注意点として、純ココアには100gあたり約200mg（大さじ1杯・6gあたり約12mg）のカフェインが含まれています。コーヒー（100mlあたり約60mg）と比較すると微量ですが、カフェイン感受性が強い人や就寝前、幼児への給餌には適度な配慮が求められます。
