ゲーム開始時、オーキド博士の研究所で提示される初期デッキの選択は、その後の攻略難易度を大きく左右します。ここで選択すべき最もおすすめの選択肢は「ヒトカゲとお友だちデッキ」です。
この選択を推奨する理由は、炎タイプそのものの強さではなく、序盤から優秀なたねアタッカーである無色タイプのポケモンや汎用ドローソースをバランスよく確保できる点にあります。序盤の攻略ロードマップにおいて、最も効率的なルートは以下の通りです。
まず最初に向かうべきは「バトルクラブ」です。ここでは序盤の難敵に対して有利に戦える闘タイプのエビワラーやワンリキー、あるいは草タイプのストライクを早期に確保します。特に「ストライク（ジャングル）」は、無色エネルギー2個で30ダメージを出せる「きりさく」を持ち、HP70、にげるエネルギー0、闘抵抗力持ちという、旧裏環境きってのパワーカードです。これを軸にした速攻ビートダウンを組むだけで、序盤の難易度は激変します。
各クラブマスターを攻略する際は、相手のデッキテーマに対する明確な弱点アプローチが不可欠です。例えば、水属性で固められた「アクアクラブ」のウツギマスターに対しては、草タイプのストライクやエレキクラブで入手したサンダー・エレブーをぶつけることで、相手のジュゴンやカメックスが育つ前に瞬殺が可能です。相手のベンチを強制的に引きずり出す「突風」を2〜3枚採用しておくだけで、育成途中のキーカードを安全に狩り取ることができます。
