公立中学校を選択する上で最大の関心事の一つが進路指導と学力水準です。末吉中学校では、生徒個々の習熟度に配慮した少人数授業の導入や、横浜市独自の学力・学習状況調査を踏まえたきめ細かな指導が展開されています。
公立高校入試においては、神奈川県立のトップ校である横浜翠嵐高校や川和高校をはじめ、近隣の人気校である市立東高校や鶴見高校、港北高校などへの進学実績をコンスタントに維持しています。私立高校の併願推薦やオープン入試を選択する家庭も多く、都内・神奈川県内の有名私立高へ進む生徒の割合も堅調です。
神奈川県の公立高校入試では中学校2年・3年の内申点が合否判定に大きく影響します。末吉中学校の定期テストは極端な難問奇問に偏ることは少なく、教科書の基礎理解と標準的なワークの反復学習が点数に反映されやすい傾向にあります。日々の提出物管理と小テスト対策を丁寧に行う生徒がしっかりと内申点を確保できるフェアな評価体制が整っています。