神戸港と小豆島を結ぶ海のメインルートを担うのは、ジャンボフェリー株式会社が運航する定期便です。出発地は各線三宮駅から連絡バスですぐの「神戸三宮フェリーターミナル」、到着地は小豆島南東部に位置する「坂手港」となります。
神戸港から小豆島（坂手港）までの所要時間は通常便（直行）で約3時間15分です。ただし、一部の高松東港経由便などを利用する場合は約6時間以上を要する変則ダイヤも存在するため、乗船便のタイムスケジュール確認は不可欠です。毎日運航されるダイヤの中でも、特に注目されているのが早朝便と深夜便です。神戸港を深夜に出発し、翌朝早くに坂手港へ到着する深夜便の時刻表パターンは、現地での滞在時間を最大化したい登山客やサイクリストから熱烈な支持を集めています。
神戸三宮フェリーターミナルへのアクセスは、JR・阪急・阪神・地下鉄の三宮駅前「ミント神戸」1階バスターミナルから発着する専用連絡バス（乗車時間約6〜8分）を利用するのが最もスムーズです。自家用車で直接向かう場合も、阪神高速3号神戸線「京橋ランプ」から約3分と抜群の立地にあります。
