行者ニンニクの醤油漬けにおいて、味の輪郭を決定づける調味料の配合には明確なセオリーが存在します。料理研究家や山菜採りの名手たちが長年の試行錯誤から導き出した普遍的な黄金比率は、「醤油2：本みりん1：酒1」の構成です。
行者ニンニクに含まれる香気成分「含硫化合物（アリシンなど）」は極めて個性が強いため、塩角の立った醤油だけでは素材の荒々しさに負けてしまいます。本みりんの上品な甘みと、酒の芳醇なアミノ酸が加わることで、ツンとした刺激が奥深いコクへと昇華します。仕込みの際は、みりんと酒をあらかじめ小鍋で約1分間沸騰させてアルコール分を飛ばす（煮切る）作業を怠ってはなりません。アルコール臭が抜けないまま漬け込むと、発酵や異味の原因となるためです。
さらに、甘みを抑えてキレのある辛口に仕上げたい場合は「醤油3：みりん1」、あるいはかつお節と昆布の出汁を効かせた自家製出汁醤油を用いる応用も有効です。アイヌネギの醤油漬けとして北海道の現地で伝承されている作り方では、保存性を最優先に「生醤油のみ」に漬ける無骨な手法も愛されていますが、日常の食卓で幅広い料理に合わせるなら、前述の2:1:1の比率が最も完成された着地点といえます。
