奈良屋の客室構成は、歴史ある伝統建築の風情を残す本館客室と、贅を尽くしたデザイナーズフロア「泉游亭（せんゆうてい）」に分かれています。
特に記念日や特別な旅行で圧倒的な支持を集めるのが「泉游亭」です。和の伝統美に現代的な機能性を融合させた設えとなっており、上質なシモンズ製ベッドや意匠を凝らした調度品が配置されています。客室タイプによっては源泉掛け流しの半露天風呂や信楽焼の陶器風呂を備えており、プライベートな空間で気兼ねなく湯守の湯を堪能できます。
実際の宿泊記や利用者の声を確認すると、「木の香りと間接照明の調和が心地よく、滞在中の遮音性も極めて高い」「モダンでありながら老舗の風格が保たれている」と絶賛されています。一方、本館の一般客室も手入れが行き届いており、歴史ある建具の温もりを感じながらリーズナブルに宿泊できる選択肢として堅調な人気を誇ります。
