領収書の山を前にして途方に暮れる納税者が多い中、実務上の負担を劇的に減らす手法が存在します。医療費控除明細書書き方の基本は、1枚ごとの領収書を時系列で入力することではありません。「医療を受けた人」と「病院・薬局などの支払先」ごとに領収書を分類し、1年間の合計額をまとめて記載することが国税庁のガイドラインで正式に認められています。
この作業を最もスムーズに進めるツールが、国税庁公式の医療費控除エクセルダウンロードサービス（医療費集計フォーム）です。国税庁ホームページから専用のExcelテンプレートを入手し、通院した家族の名前、診療を受けた病院や調剤薬局の名称、支払った金額、保険等で補填された金額をオフラインで入力していきます。
入力が完了したエクセルファイルは、国税庁確定申告書等作成コーナーにそのままアップロード（インポート）することが可能です。これにより、画面上で1件ずつ手入力する手間が省け、入力ミスや計算のズレを完全に排除できます。
また、健康保険組合などから年明けに送付されてくる「医療費のお知らせ」（医療費通知）を活用する方法もあります。この通知に記載された医療費については、明細書に合計額を1行記載し、医療費のお知らせ原本添付（e-Taxの場合は電子データ送信または記載内容の入力）を行うことで、個別の領収書集計そのものを大幅に省略できます。ただし、医療費通知に記載されていない自費診療分や市販薬、通院交通費などは別途明細書への追記が必要となる点に留意しなければなりません。
