なぜシェーグレン症候群を発症すると、外分泌腺の乾燥だけでなく全身の強い疲労感や痛みが引き起こされるのでしょうか。その根本的な原因は、本来であればウイルスや細菌などの外敵から身体を守るはずの「免疫システム」のエラーにあります。
体内にあるリンパ球などの免疫細胞が暴走し、自らの外分泌腺組織（主に涙腺や唾液腺）を異物と誤認して慢性的な炎症を起こします。この炎症反応により分泌組織が破壊され、涙や唾液の分泌量が著しく低下します。唾液には口腔内を湿らせるだけでなく、強い殺菌作用や粘膜保護作用があるため、分泌が途絶えると粘膜障害や多発性虫歯が急速に進行する仕組みです。
さらに見逃せないのが「長引く疲労感や関節痛」の正体です。免疫の異常活性化に伴い、体内では「サイトカイン」と呼ばれる炎症性物質が過剰に産生され続けます。これが血流に乗って全身を巡ることで、微熱、筋肉痛、関節痛、そして脳の神経伝達系にも影響を与え、休んでも取れない特有の「重度の倦怠感（ブレインフォグや易疲労感）」を引き起こします。
患者層の男女比を見ると、女性が全体の約9割を占めるという圧倒的な偏りがあります。特に40代から60代の中高年女性に好発することから、エストロゲンなどの女性ホルモンの分泌バランスの急変が免疫調節機能に影響を与えていると考えられています。また、遺伝的素因に加えて、ウイルス感染や強い精神的・身体的ストレス、紫外線などの環境要因が引き金となり、免疫の自己寛容破綻（自分を攻撃しない仕組みの崩壊）を招くと分析されています。
