鶴見南小学校を卒業した児童の大半は、隣接する大阪市立緑中学校の校区へ進学します。緑中学校は部活動と学習指導のバランスが取れた学校として知られ、吹奏楽部や運動部などの活動実績も豊富です。
高校受験に向けた内申点対策や学力向上に関しても、鶴見南小学校と緑中学校の間で指導要領の共有や乗り入れ授業といった「小中一貫型連携」が定期的に実施されています。小学校高学年の段階から中学校の教員が参観に来るなど、環境変化に対する児童の心理的負担を和らげる取り組みが定着しています。
また、近隣の大手学習塾への通塾率も高く、天王寺高校や大手前高校、四條畷高校といった大阪府立トップ10高（文理学科設置校）を目指す層から、有名私立中高一貫校への中学受験を選択する家庭まで、進路の多様化が進んでいます。
