2020年4月16日、藤原さんが代表取締役を務めていたAIR AGENCYより出された公式発表は、アニメ・声優業界のみならず日本全国に大きな衝撃を与えました。発表文には「弊社代表取締役および所属声優である藤原啓治が、かねてより闘病中でありましたところ、がんのため令和2年4月12日に満55歳で永眠いたしました」と記されていました。
報道各社の取材データや公式リリースを精査しても、藤原啓治さんの死因となった「がんの種類」（原発巣の部位）については一切明かされていません。ネット上では「すい臓がん」「食道がん」「スキルス胃がん」など様々な臆測が飛び交いましたが、これらはすべて確証のない噂に過ぎません。藤原さん自身、生前からプライベートを過度に誇張せず、あくまで「役者としての声」を届けることに徹していた表現者でした。病巣の部位を詳細に明かさなかった背景には、ファンに病弱なイメージを植え付けず、演じたキャラクターの生命力を損なわせたくないという、役者としての美学とプライバシー保護への強い意志が存在していました。
享年55歳という年齢は、厚生労働省の統計から見ても悪性新生物による死亡年齢の中央値よりはるかに若く、働き盛りであり表現者としても円熟味を増していた時期でした。それだけに、現場関係者やファンの受けた精神的打撃は計り知れないものがありました。
